截至2019年，五个街道全部创成江苏省生态文明建设示范街道，2021年创建成为国家级生态文明建设示范区。近年来，浦口区谱写了“生态、现代、幸福”美丽新画卷。

根据《江苏省生态空间管控区域规划》，浦口区共有国家级生态红线66.13平方公里，生态空间管控区130.49平方公里，总生态管控面积占区域总面积的27%，涉及水源水质、湿地生态系统、自然与人文景观保护、洪水调蓄和水土保持等多项生态功能。为重点掌握生态红线区域物种资源现状，系统评估生物多样性信息，2019年浦口区开展了为期一年的生物多样性调查，共调查到陆生维管植物980种，陆生脊椎动物162种，陆生昆虫219种，水生生物391种，大型真菌141种，共计1893种，其中红色名录物种27种，受保护物种30种，区内生物丰富度全省领先。

2017—2021年浦口区PM2.5均为南京市第一，2021年年均值23.7微克/立方米，在全省95个国控点中最低，达到国家空气质量一级标准，较2017年下降38.3%，超额完成化学需氧量、氨氮、总氮、总磷、二氧化硫和氮氧化物等主要污染物年度存量削减任务。建成区消除黑臭水体，境内省考断面水质全部达标，2021年浦口区城市水质综合指数在全省63个县（市、区）中排名前列。

为贯彻落实“共抓大保护、不搞大开发”要求，浦口区全面启动长江岸线专项整治行动。累计拆除龙门吊、盾构机等设备110余套，拆除建筑物13万平方米，清除水泥地坪、砂石地坪等100万平方米，共拆除30家船厂、6家混凝土企业、21个砂场，收回企业违规占地1504亩，七坝港区乱占企业全部拆除，已完成90万平方米场地复绿。昔日厂棚林立的“十里造船带”，蝶变成滨江生态风光带，江豚保护区沿岸恢复湿地公园景观，年均观测到的江豚记录达2000头/次，长江浦口段28.5公里岸线焕然一新。